Согласно Федеральному закону "Об особо охраняемых природных территориях", ботанические сады и дендрологические парки России представляют самостоятельную категорию особо охраняемых природных территорий. Основные направления их деятельности включают создание специальных коллекций растений с целью сохранения биоразнообразия, а также осуществление научной, учебной и просветительской деятельности.

Алтайский филиал ЦСБС СО РАН "Горно-Алтайский ботанический сад" (ГАБС) организован в 1994 году на площади 59,7 га в окрестностях с. Камлак Шебалинского района.

Основные направления его деятельности включают создание специальных коллекций растений с целью сохранения биоразнообразия, осуществление научной, учебной и просветительской деятельности. Одной из важнейших задач ботсада является исследование природных популяций редких, исчезающих и эндемичных видов и интродукция их в условиях ботанического сада для сохранения генофонда уникальной флоры.

За годы существования на территории сада были созданы следующие экспозиции:
Экологические экспозиции «Альпинарий», «Сухой ручей»; тематические экспозиции «Пряно-ароматический сад», «Сад декоративных хвойных»; географические экспозиции «Дальний Восток», «Европа», «Северная Америка», «Сибирь».

Живые коллекции растений содержатся не только в экспозиционных посадках, но и в виде искусственных ценозов (экспозиция «Степь»). Коллекция живых растений, собранная в филиале, в настоящее время насчитывает 1500 видов, сортов, форм и разновидностей из разных климатических зон. Семенной фонд составляет 653 вида.

Горно-Алтайский ботанический сад ведет большую научную работу по изучению флоры и растительности республики, инвентаризации флористических ресурсов; создаются питомники и коллекции экономически важных видов (пищевых, кормовых, лекарственных, декоративных и др.). Особое внимание уделяется представителям местной флоры, малоизученным и наиболее значимым при восстановлении деградированных растительных сообществ. Постоянно ведутся работы по закладке тематических экспозиций, пополнению существующих коллекций, проводятся изучение в природе и культуре редких и исчезающих видов растений республики.

За последние годы изданы более 10 работ научно-популярного, учебно-методического характера, материалы и труды конференций, монографии. Впервые для Республики Алтай совместно с ЦСБС, ГАГУ опубликована «Красная книга Республики Алтай (растения)» (1996; 2007; 2017), «Определитель растений Республики Алтай» (2012) и др.

На базе ботанического сада ежегодно проводятся студенческие практики, семинары, конференции. Сотрудники выезжают на экспедиции по разным районам Республики Алтай. Организовываются совместные Международные экспедиции (Германия, Америка, Чехия, Ирландия, Китай).

Сотрудниками поддерживаются связи со многими научными учреждениями СО РАН, вузами Сибири. Ботанический сад участвует в Международных проектах ПРООН/ГЭФ, Фонда дикой природы (WWF), РФФИ, республиканских конкурсах научно-исследовательских проектов и др.

Ежегодно ботанический сад посещают более восьми тысяч гостей из разных регионов России, ближнего и дальнего зарубежья. По экспозициям сада проводятся научно-познавательные экскурсии, реализуется посадочный материал.